Taxonomical status of Swertia alpestris Baumg. ex Fuss from the territory of Ukraine based on the analysis of the ITS2 secondary structure
Keywords:
plant systematics, molecular taxonomy, Swertia alpestris, Swertia perennis, second structure ITS2, Ukraine.Abstract
Based on results of comparative ITS2 secondary structure sequence analysis from the nuclear-encoding ribosomal genes, species status was tested from subalpine population from Ukrainian Carpathian region that were identified using morphological criteria as Swertia alpestris Baumg. ex Fuss. It was found that at the secondary structure ITS2 Swertia alpestris has not differences from species of other populations, that were identified as Swertia perennis L. The taxonomical status of Swertia alpestris are discussed.
References
BELDIE AL. (1977-1979). Flora Romaniei. Determinator ilustrat al plantelor vasculare. Bucuresti: Editura Academiei Republicii Socialiste Romania. 1, 2. 405 p.
BERTOVA L. (1984). Swertia L. Kropenáč. Flora Slovenska. Bratislava: VEDA, vidavatelstvo Slovenskej akademie vied. 4 (1): 95-99.
BUCHHEIM M.A., KELLER A., KOETSCHAN C., FORSTER F., MERGET B. et al. (2011). Internal transcribed spacer 2 (nu ITS2 rRNA) sequence-structure phylogenetics: towards an automated reconstruction of the green algal tree of life. PLoS One, 6 (2): 1-10.
CHASSOT P., NEMOMISSA S., YUAN Y.-M., KUPHER P. (2001). High paraphyly of Swertia L. (Gentianaceae) in the Gentianella-lineage as revealed by nuclear and chloroplast DNA sequence variation. Plant Syst. and Evol., 229: 1-21.
CHERVONA knyga Ukrainy. Roslynnyi svit (2009). K.: Globalconsaltyng. 900 p. [ЧЕРВОНА книга України. Рослинний світ (2009) / за ред. ДІДУХА Я.П. К.: Глобалконсалтинг. 900 c.]
COLEMAN A. W. (2007). Pan-eukaryote ITS2 homologies revealed by RNA secondary structure. Nucl. Acids Res., 35: 3322-3329.
COLEMAN A.W. (2003). ITS2 is a double-edged tool for eukaryote evolutionary comparisons. Trends Genet. 19: 370-375.
DENDUANGBORIPANT J., CRONK Q.C.B. (2001). Evolution and alignment of the hypervariable arm 1 of Aeschynanthus (Gesneriaceae) ITS2 nuclear ribosomal DNA. Mol. Phylogenet. Evol., 20: 163-172
DOBROCHAEVA D.N., KOTOV M.I., PROKUDIN YU.N. et al. (1987). Opredelitel vysshyh rasteniy Ukrainy. Kiev: Naukova dumka. 548 p [ДОБРОЧАЕВА Д.Н., КОТОВ М.И., ПРОКУДИН Ю.Н. и др. (1987). Определитель высших растений Украины. Киев: Наукова думка. 548 с.]
DOSTAL J. (1916). Nova květena ČSSR. 1, 2. Praha: Československa akademie ved. 1563 p.
FODOR S.S. (1974). Flora Zakarpattja. Lviv: Vyshcha shkola. 207 p. [ФОДОР С.С. (1974). Флора Закарпаття. Львів: Вища школа. 1974. 207с.]
FUSS M. (1846). Mantissa ad floram Transsilvaniae. In: Baumgarten J.Ch.G. Enumerationis Stirpium Transilvaniae Indigenarum IV. Mantissa I. Cibinii: Typis Theod. Steinhaussen. P. 1-82.
GOERTZEN L.R., CANNONE J.J., GUTELL R.R., JANSEN R.K. (2003). ITS secondary structure derived from comparative analysis: implications for sequence alignment and phylogeny of the Asteraceae. Mol. Phylogenet. Evol., 29: 216-234
JAVORKA S. (1924-1925). Magyar Flora (Flora Hungarica).Budapest: Studium. 1307 p.
KÁRPÁTI Z. (1970). Eine kritisch-taxonomische Ubersicht der Gattung Swertia in Europa. Fragm. Florist. Geobot, 16: 53-59.
MAI J.C., COLEMAN A.W. (1997). The Internal Transcribed Spacer 2 Exhibits a Common Secondary Structure in Green Algae and Flowering Plants. J. Mol. Evol., 44: 258-271.
MARHOLD K. (2011). Gentianaceae. In: EURO+MED PLANTBASE – THE INFORMATION RESOURCE FOR EURO-MEDITERRANEAN PLANT DIVERSITY (http://ww2.bgbm.org/EuroPlusMed/).
MERGET B., KOETSCHAN C., HACKL T., FÖRSTER F., DANDEKAR T., MÜLLER T., SCHULTZ J., WOLF M. (2012). The ITS2 Database. J Vis Exp., 12 (61): 3791-3806.
MOSYAKIN S.L., FEDORONCHUK M.M. (1999). Vascular plants of Ukraine. A nomenclatural checklist. Kiev. 346 p.
PISJAUKOVA V.V. (1978). Rod 8. Swertia L. Flora evropeiskoi chasti SSSR. Leningrad: Isd-vo Nauka, Leningrad. otdelenije. 3: 82-85 [ПИСЬЯУКОВА В.В. (1978). Род 8. Сверция – SWERTIA L. Флора Европейской части СССР. Ленинград: Изд-во Наука, Ленинград. отделение. 3: 82-85]
ROTHMALER W. (BEGR.), JÄGER E., WERNER K. (Eds.). (2005). Exkursionflora von Deutschland. Band 4: Gefäßpflanzen: Kritischer Band. 10. völlig neu bearb. Aufl. München: Elsevier. P. 7.
SIMONKAI L. (1886). Enumeratio Florae Transsilvanicae vesculosae critica. Budapest: Kir. Mady. Term. tud. Társ. 678 p.
SZAFER W., KULCZYСSKI S., PAWІOWSKI B. (1988). Rosliny Polskie. Opisy i klucze do oznaczania wszystkich gatunków roślin naczyniowych rosnących w Polsce bądź dziko bądź teź zdziczałych lub częściej hodowanych. Warszawa: Paсstwowe wydawnictwo naukowe. 6 (2): 465-1020 (Swertia – S. 606-607).
TAREEV A.S., GIRIN A.S., KARPENKO N.I., TYSHENKO O.V., KOSTIKOV I.YU. (2011). Chornomors’k. bot. z., 7 (4): 309-317. [ТАРЄЄВ А.С., ГІРІН А.С., КАРПЕНКО Н.І., ТИЩЕНКО О.В., КОСТІКОВ І.Ю. (2011). Модифікована методика виділення ДНК з гербарних зразків. Чорноморськ. бот. ж., 7 (4): 309-317]
TOPA E. (1961). Fam. 96. Gentianaceae B. Juss. Flora Reipublicii Populare Romоne. Bucuresti: Editura Academiei Republicii Populare Române. 8: 430-479.
TUTIN T.G. et al. (eds) (1972). Swertia L. Flora Europaea, Cambridge University Press. Cambridge. P. 67.
VISYULINA O.D. (1957). Rodyna CXV. Tyrlychevi – Gentianaceae Dumort. Flora URSR. K.: vyd-vo AN URSR. 8: 221-260 [ВІСЮЛІНА О.Д. (1957). Родина CXV. Тирличеві – Gentianaceae Dumort. Флора УРСР. К.: Вид-во АН УРСР. 8: 221-260]
VYZNACHNYK roslyn ukrainskyh Karpat (1977). K.: Nauk. dumka. 435 p. [ВИЗНАЧНИК рослин Українських Карпат (1977). К.: Наук. думка. 435 с.]
VYZNACHNYK roslyn URSR (1950). K.: Derzhavne vydavnytstvo silskogospodarskoi literatury URSR. 932 p. [ВИЗНАЧНИК рослин УРСР (1950). К.: Державне видавництво сільськогоподарської літератури УРСР. 932 с.]
WHITE T.J., BRUNS T., LEE S., TAYLOR J. (1990). Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. PCR protocols: a guide to methods and applications. Academic Press, San Diego, CA. P. 315-322.
ZUKER M. (2003). Mfold web server for nucleic acid folding and hybridization prediction. Nucleic Acids Res., 31 (13): 3406-3415.
